18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4940 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_4940  hypothetical protein  100 
 
 		 178 aa  345  1e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0042  hypothetical protein  55.98 
 
 		 188 aa  168  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.53163 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0962  response regulator receiver  46.49 
 
 		 169 aa  134  8e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0882879  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2434  hypothetical protein  57.14 
 
 		 183 aa  132  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.13774  normal  0.165313 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1186  hypothetical protein  53.9 
 
 		 175 aa  125  4.0000000000000003e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.785944  hitchhiker  0.000092673 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5833  hypothetical protein  44.62 
 
 		 178 aa  121  5e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7592  hypothetical protein  42.37 
 
 		 176 aa  119  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.136028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3129  hypothetical protein  45.76 
 
 		 179 aa  115  3.9999999999999997e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4137  hypothetical protein  52.75 
 
 		 201 aa  105  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.969888  normal  0.385246 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2083  response regulator receiver  49.16 
 
 		 167 aa  104  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.271668  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4275  hypothetical protein  39.87 
 
 		 168 aa  85.5  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5812  HicB family protein  37.18 
 
 		 185 aa  77.8  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4408  hypothetical protein  38.28 
 
 		 164 aa  75.1  0.0000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0233078  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1717  hypothetical protein  35.08 
 
 		 186 aa  71.6  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.112681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25290  HicB family protein  37.5 
 
 		 173 aa  70.5  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0558474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2234  hypothetical protein  34.04 
 
 		 189 aa  62  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000124659  normal  0.392099 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0284  hypothetical protein  50.79 
 
 		 65 aa  56.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0338  CopG family transcriptional regulator  41.14 
 
 		 167 aa  56.6  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.190218  hitchhiker  0.000976234 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>