14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2234 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2234  hypothetical protein  100 
 
 		 189 aa  373  1e-103  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000124659  normal  0.392099 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5812  HicB family protein  49.69 
 
 		 185 aa  134  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25290  HicB family protein  44.89 
 
 		 173 aa  116  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0558474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0042  hypothetical protein  31.25 
 
 		 188 aa  75.9  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.53163 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4940  hypothetical protein  34.39 
 
 		 178 aa  74.7  0.0000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4275  hypothetical protein  34.9 
 
 		 168 aa  71.2  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3129  hypothetical protein  31.94 
 
 		 179 aa  69.7  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0962  response regulator receiver  34.25 
 
 		 169 aa  68.9  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0882879  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4408  hypothetical protein  29.17 
 
 		 164 aa  53.1  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0233078  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7592  hypothetical protein  29.79 
 
 		 176 aa  52.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.136028  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1717  hypothetical protein  35.8 
 
 		 186 aa  52  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.112681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1186  hypothetical protein  42.65 
 
 		 175 aa  50.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.785944  hitchhiker  0.000092673 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4137  hypothetical protein  35 
 
 		 201 aa  48.9  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.969888  normal  0.385246 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2434  hypothetical protein  33.33 
 
 		 183 aa  45.4  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.13774  normal  0.165313 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>