18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1186 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1186  hypothetical protein  100 
 
 
175 aa  332  1e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.785944  hitchhiker  0.000092673 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0042  hypothetical protein  56.61 
 
 
188 aa  172  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.53163 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4940  hypothetical protein  56.11 
 
 
178 aa  168  3e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0962  response regulator receiver  50.27 
 
 
169 aa  141  5e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0882879  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2434  hypothetical protein  61.36 
 
 
183 aa  140  6e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.13774  normal  0.165313 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2083  response regulator receiver  59.09 
 
 
167 aa  140  8e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.271668  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5833  hypothetical protein  49.46 
 
 
178 aa  135  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3129  hypothetical protein  52.81 
 
 
179 aa  135  2e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7592  hypothetical protein  48.31 
 
 
176 aa  127  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.136028  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4137  hypothetical protein  51.89 
 
 
201 aa  109  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.969888  normal  0.385246 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4275  hypothetical protein  42.46 
 
 
168 aa  91.7  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1717  hypothetical protein  38.1 
 
 
186 aa  76.3  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.112681  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5812  HicB family protein  38.41 
 
 
185 aa  71.6  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2234  hypothetical protein  32.8 
 
 
189 aa  70.9  0.000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000124659  normal  0.392099 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4408  hypothetical protein  37.11 
 
 
164 aa  66.6  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0233078  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0284  hypothetical protein  55.56 
 
 
65 aa  62.8  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0338  CopG family transcriptional regulator  37.78 
 
 
167 aa  60.5  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.190218  hitchhiker  0.000976234 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25290  HicB family protein  33.89 
 
 
173 aa  57  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0558474  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>