13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0284 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0284  hypothetical protein  100 
 
 		 65 aa  124  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0962  response regulator receiver  53.12 
 
 		 169 aa  58.9  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0882879  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0042  hypothetical protein  49.23 
 
 		 188 aa  57.4  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.53163 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4940  hypothetical protein  50.79 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5833  hypothetical protein  54.55 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4137  hypothetical protein  42.86 
 
 		 201 aa  51.6  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.969888  normal  0.385246 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7592  hypothetical protein  42.86 
 
 		 176 aa  50.4  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.136028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3129  hypothetical protein  45.31 
 
 		 179 aa  48.9  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2434  hypothetical protein  44.62 
 
 		 183 aa  47.4  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.13774  normal  0.165313 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1717  hypothetical protein  44.44 
 
 		 186 aa  47.4  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.112681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2083  response regulator receiver  55.56 
 
 		 167 aa  46.2  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.271668  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4275  hypothetical protein  62.5 
 
 		 168 aa  42.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0338  CopG family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 167 aa  41.2  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.190218  hitchhiker  0.000976234 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>