186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_R0041 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008701  Pisl_R0031  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.759834 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0041  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0013  tRNA-Met  100 
 
 		 94 bp  79.8  0.00000000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.459388  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0015  tRNA-Met  95 
 
 		 103 bp  63.9  0.000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0010  tRNA-Met  94.74 
 
 		 98 bp  60  0.00000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00876921 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0082  tRNA-Met  86.15 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0018  tRNA-Met  89.58 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0023  tRNA-Met  89.58 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.216301  normal  0.182837 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0051  tRNA-Met  89.58 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0332583 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0088  tRNA-Met  89.58 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0011  tRNA-Met  89.58 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.903466 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0054  tRNA-Met  89.58 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0027  tRNA-Met  89.58 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19050  tRNA-Met  89.58 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0024  tRNA-Met  89.58 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0047  tRNA-Met  89.58 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.985232  normal  0.0659545 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0049  tRNA-Met  89.58 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0512381 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0020  tRNA-Met  89.58 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.152661  normal  0.0163497 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0021  tRNA-Met  89.58 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.097858  normal  0.0168782 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0049  tRNA-Met  89.58 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297044  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0046  tRNA-Met  89.58 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0668853 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0054  tRNA-Met  89.58 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0011  tRNA-Met  89.36 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0012  tRNA-Met  89.13 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.212092  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0013  tRNA-Met  89.13 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.156477  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0026  tRNA-Met  89.13 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0055  tRNA-Met  89.13 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0050  tRNA-Met  89.13 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0424906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0062  tRNA-Met  89.13 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0025  tRNA-Met  89.13 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0042  tRNA-Met  89.13 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.101529  hitchhiker  0.00000213655 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0026  tRNA-Met  89.13 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0023  tRNA-Met  89.13 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27400  tRNA-Met  89.13 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0222843  normal  0.668834 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0037  tRNA-Met  89.13 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.48693 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1356  tRNA-Met  89.13 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.969712 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0063  tRNA-Met  89.13 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.43322  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0040  tRNA-Met  89.13 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0013  tRNA-Met  89.13 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0374183  normal  0.419184 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00051  tRNA-Met  84.62 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00052  tRNA-Met  84.62 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00053  tRNA-Met  84.62 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0017  tRNA-Met  84.62 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.687744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0018  tRNA-Met  84.62 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.701161  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0019  tRNA-Met  84.62 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.69794  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0029  tRNA-Met  84.62 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.992262  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0069  tRNA-Met  84.62 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.043282  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3152  tRNA-Met  84.62 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.469971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0035  tRNA-Met  84.62 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  1.84698e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3316  tRNA-Met  84.62 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.863126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3646  tRNA-Met  84.62 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.981191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4080  tRNA-Met  84.62 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0909328  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0063  tRNA-Met  84.62 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0015  tRNA-Met  88.89 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.74865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3584  tRNA-Met  84.62 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3135  tRNA-Met  84.62 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.369915  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3315  tRNA-Met  84.62 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.583787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3478  tRNA-Met  84.62 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3479  tRNA-Met  84.62 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.344656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0048  tRNA-Met  88.89 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0049  tRNA-Met  88.89 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0081  tRNA-Met  84.62 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0120643  normal  0.12492 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4081  tRNA-Met  84.62 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0905537  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0027  tRNA-Met  84.62 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.992262  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0070  tRNA-Met  84.62 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.628409  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4212  tRNA-Met  84.62 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.353774  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4213  tRNA-Met  84.62 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.355481  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4214  tRNA-Met  84.62 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.426963  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4276  tRNA-Met  84.62 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000119762  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3216  tRNA-Met  84.62 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3215  tRNA-Met  84.62 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4693  tRNA-Met  84.62 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.83874  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4694  tRNA-Met  84.62 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3202  tRNA-Met  84.62 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.148125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0026  tRNA-Met  84.62 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.116452  normal  0.378312 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0088  tRNA-Met  84.62 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0282515  hitchhiker  0.000000388022 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0050  tRNA-Met  88.89 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0359841 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0051  tRNA-Met  88.89 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0345876 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0023  tRNA-Met  87.76 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3153  tRNA-Met  84.62 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.311913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3226  tRNA-Met  84.62 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0172509  normal  0.439997 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3227  tRNA-Met  84.62 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0186102  normal  0.434912 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3990  tRNA-Met  84.62 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000448395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0052  tRNA-Met  84.62 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00733518  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0080  tRNA-Met  84.62 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0693639  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0081  tRNA-Met  84.62 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0699076  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0082  tRNA-Met  84.62 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0688432  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0013  tRNA-Met  84.62 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000085866 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0019  tRNA-Met  84.62 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0020  tRNA-Met  84.62 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0021  tRNA-Met  84.62 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2955  tRNA-Met  84.62 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.14009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2956  tRNA-Met  84.62 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.211186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2957  tRNA-Met  84.62 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.220059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3467  tRNA-Met  84.62 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.139541  normal  0.865403 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4079  tRNA-Met  84.62 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0890507  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0062  tRNA-Met  84.62 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0070  tRNA-Met  84.62 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0467546  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3183  tRNA-Met  84.62 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0047  tRNA-Met  88.89 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00182581 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>