12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_R0015 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_R0015  tRNA-Met  100 
 
 		 103 bp  204  3e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0031  tRNA-Met  95 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.759834 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0041  tRNA-Met  95 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0013  tRNA-Met  94.59 
 
 		 94 bp  58  0.0000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.459388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0010  tRNA-Met  91.11 
 
 		 98 bp  58  0.0000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00876921 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1356  tRNA-Met  92.11 
 
 		 77 bp  52  0.00003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.969712 
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Met-3  tRNA-Met  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0002  tRNA-Met  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0017  tRNA-Met  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0046  tRNA-Met  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.918384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0002  tRNA-Met  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.287146 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0005  tRNA-Met  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>