28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_R0010 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_R0010  tRNA-Met  100 
 
 		 98 bp  194  3e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00876921 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0041  tRNA-Met  94.74 
 
 		 77 bp  60  0.0000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0013  tRNA-Met  94.74 
 
 		 94 bp  60  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.459388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0031  tRNA-Met  94.74 
 
 		 77 bp  60  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.759834 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0015  tRNA-Met  91.11 
 
 		 103 bp  58  0.0000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAIleVIMSS1309203  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  48.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.765225  normal  0.83434 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0043  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0208406  normal  0.220068 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0022  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.362568  normal  0.10266 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0028  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.568304 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0012  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0042  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0023  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAIleVIMSS1309371  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  48.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.284723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAIleVIMSS1309162  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  48.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAIleVIMSS1309289  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  48.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAIleVIMSS1309281  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  48.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.126115 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAIleVIMSS1309139  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  48.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAIleVIMSS1309088  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  48.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0028  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000471614  decreased coverage  0.000367782 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0015  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000549591  normal  0.119153 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0033  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000000982153  normal  0.21977 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0022  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000102931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0010  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  48.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0050  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  48.1  0.0004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0017  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  48.1  0.0004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0314309  normal  0.837845 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0033  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  48.1  0.0004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0006  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  48.1  0.0004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0037  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  48.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>