14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0346 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0346  band 7 protein  100 
 
 
341 aa  669    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00220198  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5758  band 7 protein  61.68 
 
 
357 aa  400  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000720361  unclonable  0.00000000000000102011 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5114  hypothetical protein  60.78 
 
 
345 aa  394  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.227587 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1041  band 7 protein  55.22 
 
 
339 aa  382  1e-105  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6366  hypothetical protein  28.7 
 
 
341 aa  133  3.9999999999999996e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2357  band 7 protein  32.72 
 
 
335 aa  124  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000807905  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4338  band 7 protein  31.44 
 
 
326 aa  122  7e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461257  normal  0.296553 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4450  band 7 protein  33.49 
 
 
326 aa  122  9e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.330245 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3970  band 7 protein  31.44 
 
 
326 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.104897  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1759  band 7 protein  29.55 
 
 
384 aa  118  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4132  band 7 protein  28.91 
 
 
334 aa  114  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5159  band 7 protein  30 
 
 
328 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6652  band 7 protein  34.62 
 
 
354 aa  112  8.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5180  band 7 protein  36.78 
 
 
509 aa  59.7  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>