13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4338 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_4338  band 7 protein  100 
 
 		 326 aa  636    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461257  normal  0.296553 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3970  band 7 protein  98.77 
 
 		 326 aa  628  1e-179  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.104897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4450  band 7 protein  95.71 
 
 		 326 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.330245 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5159  band 7 protein  76.38 
 
 		 328 aa  491  9.999999999999999e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6366  hypothetical protein  46.42 
 
 		 341 aa  287  2e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4132  band 7 protein  42.06 
 
 		 334 aa  219  3.9999999999999997e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1759  band 7 protein  37.4 
 
 		 384 aa  209  7e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2357  band 7 protein  40.48 
 
 		 335 aa  193  4e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000807905  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6652  band 7 protein  38.01 
 
 		 354 aa  191  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0346  band 7 protein  31.44 
 
 		 341 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00220198  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1041  band 7 protein  30.75 
 
 		 339 aa  129  7.000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5758  band 7 protein  27.98 
 
 		 357 aa  109  5e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000720361  unclonable  0.00000000000000102011 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5114  hypothetical protein  28.74 
 
 		 345 aa  100  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.227587 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>