13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5159 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5159  band 7 protein  100 
 
 
328 aa  630  1e-180  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4338  band 7 protein  76.38 
 
 
326 aa  473  1e-132  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461257  normal  0.296553 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3970  band 7 protein  76.07 
 
 
326 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.104897  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4450  band 7 protein  78.22 
 
 
326 aa  462  1e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.330245 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6366  hypothetical protein  46.75 
 
 
341 aa  295  9e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4132  band 7 protein  44 
 
 
334 aa  215  8e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1759  band 7 protein  37.36 
 
 
384 aa  209  8e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6652  band 7 protein  38.64 
 
 
354 aa  187  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2357  band 7 protein  40.55 
 
 
335 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000807905  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1041  band 7 protein  31.64 
 
 
339 aa  120  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0346  band 7 protein  30 
 
 
341 aa  112  6e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00220198  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5114  hypothetical protein  30.27 
 
 
345 aa  103  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.227587 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5758  band 7 protein  28.7 
 
 
357 aa  102  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000720361  unclonable  0.00000000000000102011 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>