15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4132 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4132  band 7 protein  100 
 
 		 334 aa  639    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1759  band 7 protein  56.01 
 
 		 384 aa  359  4e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6652  band 7 protein  58.89 
 
 		 354 aa  342  8e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2357  band 7 protein  60 
 
 		 335 aa  317  2e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000807905  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6366  hypothetical protein  46.41 
 
 		 341 aa  283  4.0000000000000003e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5159  band 7 protein  44 
 
 		 328 aa  227  2e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4338  band 7 protein  43.3 
 
 		 326 aa  219  7e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461257  normal  0.296553 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3970  band 7 protein  42.68 
 
 		 326 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.104897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4450  band 7 protein  46.28 
 
 		 326 aa  207  1e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.330245 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1041  band 7 protein  33.43 
 
 		 339 aa  156  5.0000000000000005e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5758  band 7 protein  31.31 
 
 		 357 aa  125  9e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000720361  unclonable  0.00000000000000102011 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0346  band 7 protein  31.09 
 
 		 341 aa  124  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00220198  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5114  hypothetical protein  29.07 
 
 		 345 aa  106  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.227587 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5558  band 7 protein  29.19 
 
 		 498 aa  47.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.033343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5180  band 7 protein  25.18 
 
 		 509 aa  43.1  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>