14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2357 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2357  band 7 protein  100 
 
 
335 aa  652    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000807905  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1759  band 7 protein  54.67 
 
 
384 aa  368  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4132  band 7 protein  60 
 
 
334 aa  340  2e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6652  band 7 protein  56.73 
 
 
354 aa  331  1e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6366  hypothetical protein  46.65 
 
 
341 aa  288  1e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5159  band 7 protein  41.16 
 
 
328 aa  227  2e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3970  band 7 protein  41.69 
 
 
326 aa  227  3e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.104897  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4338  band 7 protein  41.69 
 
 
326 aa  225  7e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461257  normal  0.296553 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4450  band 7 protein  41.99 
 
 
326 aa  216  5e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.330245 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1041  band 7 protein  33.23 
 
 
339 aa  160  4e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5114  hypothetical protein  32.55 
 
 
345 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.227587 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0346  band 7 protein  31.1 
 
 
341 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00220198  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5758  band 7 protein  31.14 
 
 
357 aa  135  7.000000000000001e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000720361  unclonable  0.00000000000000102011 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5558  band 7 protein  31.15 
 
 
498 aa  53.1  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.033343  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>