14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5758 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5758  band 7 protein  100 
 
 		 357 aa  712    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000720361  unclonable  0.00000000000000102011 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5114  hypothetical protein  60.78 
 
 		 345 aa  412  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.227587 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0346  band 7 protein  62.02 
 
 		 341 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00220198  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1041  band 7 protein  54.63 
 
 		 339 aa  370  1e-101  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6366  hypothetical protein  32.19 
 
 		 341 aa  134  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4132  band 7 protein  33.79 
 
 		 334 aa  123  5e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1759  band 7 protein  29.21 
 
 		 384 aa  119  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2357  band 7 protein  32.47 
 
 		 335 aa  117  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000807905  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6652  band 7 protein  29.48 
 
 		 354 aa  106  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3970  band 7 protein  28.19 
 
 		 326 aa  106  7e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.104897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4338  band 7 protein  27.89 
 
 		 326 aa  105  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461257  normal  0.296553 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5159  band 7 protein  28.92 
 
 		 328 aa  105  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4450  band 7 protein  28.7 
 
 		 326 aa  101  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.330245 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5180  band 7 protein  29.17 
 
 		 509 aa  53.9  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>