16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6652 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6652  band 7 protein  100 
 
 		 354 aa  682    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1759  band 7 protein  54.55 
 
 		 384 aa  354  1e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4132  band 7 protein  58.89 
 
 		 334 aa  342  5e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2357  band 7 protein  56.73 
 
 		 335 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000807905  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6366  hypothetical protein  42.61 
 
 		 341 aa  257  2e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5159  band 7 protein  39.82 
 
 		 328 aa  199  7.999999999999999e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3970  band 7 protein  39.47 
 
 		 326 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.104897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4338  band 7 protein  39.18 
 
 		 326 aa  196  6e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461257  normal  0.296553 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4450  band 7 protein  38.48 
 
 		 326 aa  185  8e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.330245 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1041  band 7 protein  32.45 
 
 		 339 aa  157  2e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0346  band 7 protein  34.04 
 
 		 341 aa  126  5e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00220198  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5114  hypothetical protein  31.41 
 
 		 345 aa  125  8.000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.227587 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5758  band 7 protein  29.71 
 
 		 357 aa  115  7.999999999999999e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000720361  unclonable  0.00000000000000102011 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1223  band 7 protein  35.14 
 
 		 507 aa  46.6  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5721  band 7 protein  32.79 
 
 		 681 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0977085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5558  band 7 protein  27.64 
 
 		 498 aa  43.5  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.033343  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>