39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0091 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0091  3H domain-containing protein  100 
 
 
167 aa  328  1e-89  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000249824  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0638  3H domain-containing protein  59.88 
 
 
163 aa  201  3e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.286476  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1265  3H domain-containing protein  52.5 
 
 
175 aa  171  3.9999999999999995e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.850149  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1190  3H domain-containing protein  52.5 
 
 
173 aa  171  3.9999999999999995e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000368504  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0475  3H domain-containing protein  45.91 
 
 
170 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000268079  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3598  3H domain protein  49.35 
 
 
169 aa  144  4.0000000000000006e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2412  3H domain protein  43.31 
 
 
174 aa  137  7e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.063026  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0107  3H  44.1 
 
 
169 aa  132  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.136307  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3730  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  43.23 
 
 
170 aa  127  6e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000398262  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2254  Helix-turn-helix type 11 domain protein  41.36 
 
 
169 aa  127  9.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00454086 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2341  3H domain protein  38.99 
 
 
178 aa  121  4e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000864988  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3147  3H domain-containing protein  36.2 
 
 
181 aa  114  5e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00899372  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4278  3H domain-containing protein  35.58 
 
 
180 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000110605  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4517  hypothetical protein  35.58 
 
 
180 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4565  hypothetical protein  35.58 
 
 
180 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4550  hypothetical protein  35.58 
 
 
180 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000106281  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4512  hypothetical protein  35.58 
 
 
180 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.344056 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4664  hypothetical protein  35.58 
 
 
180 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4177  transcriptional regulator  35.58 
 
 
180 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000502629  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4166  transcriptional regulator  35.58 
 
 
180 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4329  hypothetical protein  35.58 
 
 
180 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0917  small molecule binding protein  33.54 
 
 
171 aa  111  4.0000000000000004e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000158366  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0685  hypothetical protein  34.97 
 
 
180 aa  110  6e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0313179  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0915  3H domain protein  37.24 
 
 
179 aa  105  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1531  Helix-turn-helix type 11 domain protein  39.19 
 
 
166 aa  104  6e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000666791  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1547  3H domain protein  36.2 
 
 
191 aa  102  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2533  3H domain protein  34.97 
 
 
179 aa  102  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1603  biotin repressor family transcriptional regulator  34.57 
 
 
173 aa  99  3e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00245207  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1648  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  42.42 
 
 
326 aa  52.8  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1871  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  43.33 
 
 
332 aa  44.7  0.0006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000312804  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1789  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  31.82 
 
 
326 aa  44.3  0.0009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1015  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  37.29 
 
 
326 aa  43.1  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.207907  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2669  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  43.1 
 
 
312 aa  43.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1468  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  39.13 
 
 
329 aa  42  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0244  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  39.39 
 
 
329 aa  41.6  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.63219  normal  0.860661 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0691  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  41.07 
 
 
330 aa  41.6  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.382259 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3821  hypothetical protein  39.68 
 
 
232 aa  41.6  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3184  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  32.43 
 
 
326 aa  41.2  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1261  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  37.1 
 
 
326 aa  40.8  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>