39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2254 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_2254  Helix-turn-helix type 11 domain protein  100 
 
 
169 aa  342  1e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00454086 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0475  3H domain-containing protein  50.91 
 
 
170 aa  175  3e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000268079  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2341  3H domain protein  47.17 
 
 
178 aa  157  7e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000864988  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0107  3H  47.02 
 
 
169 aa  153  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.136307  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2412  3H domain protein  45.56 
 
 
174 aa  143  9e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.063026  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1265  3H domain-containing protein  42.42 
 
 
175 aa  142  2e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.850149  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1190  3H domain-containing protein  42.42 
 
 
173 aa  142  2e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000368504  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3147  3H domain-containing protein  40.83 
 
 
181 aa  141  4e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00899372  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2533  3H domain protein  43.79 
 
 
179 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1547  3H domain protein  44.05 
 
 
191 aa  139  3e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4565  hypothetical protein  39.76 
 
 
180 aa  134  4e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4517  hypothetical protein  39.76 
 
 
180 aa  134  4e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4329  hypothetical protein  39.76 
 
 
180 aa  134  4e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4166  transcriptional regulator  39.76 
 
 
180 aa  134  4e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4512  hypothetical protein  39.76 
 
 
180 aa  134  4e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.344056 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4550  hypothetical protein  39.76 
 
 
180 aa  134  4e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000106281  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4177  transcriptional regulator  39.76 
 
 
180 aa  134  4e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000502629  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4664  hypothetical protein  39.76 
 
 
180 aa  134  4e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0915  3H domain protein  43.37 
 
 
179 aa  134  5e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4278  3H domain-containing protein  39.16 
 
 
180 aa  133  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000110605  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0685  hypothetical protein  39.16 
 
 
180 aa  133  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0313179  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3730  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  40 
 
 
170 aa  128  3e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000398262  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3598  3H domain protein  39.52 
 
 
169 aa  127  6e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0091  3H domain-containing protein  41.36 
 
 
167 aa  127  9.000000000000001e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000249824  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0638  3H domain-containing protein  37.35 
 
 
163 aa  125  2.0000000000000002e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.286476  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0917  small molecule binding protein  36.9 
 
 
171 aa  119  3e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000158366  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1603  biotin repressor family transcriptional regulator  37.58 
 
 
173 aa  118  3.9999999999999996e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00245207  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1531  Helix-turn-helix type 11 domain protein  35.54 
 
 
166 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000666791  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1514  CBS domain-containing protein  28.38 
 
 
219 aa  47  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4305  Helix-turn-helix type 11 domain protein  43.86 
 
 
233 aa  44.3  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2105  hypothetical protein  40.35 
 
 
228 aa  44.3  0.0008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2094  hypothetical protein  40.35 
 
 
228 aa  44.3  0.0008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0831  transcriptional regulator-like  42.62 
 
 
244 aa  43.9  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0455803 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5970  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  38.6 
 
 
241 aa  43.9  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.392838 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1468  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  39.29 
 
 
329 aa  43.1  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1871  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  40.35 
 
 
332 aa  42.4  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000312804  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5977  Helix-turn-helix type 11 domain protein  39.34 
 
 
231 aa  42  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.374689  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3821  hypothetical protein  43.14 
 
 
232 aa  41.2  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3646  Helix-turn-helix type 11 domain protein  46.51 
 
 
230 aa  40.8  0.009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>