31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3730 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3730  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  100 
 
 		 170 aa  343  4e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000398262  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0475  3H domain-containing protein  51.18 
 
 		 170 aa  167  8e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000268079  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1265  3H domain-containing protein  44.31 
 
 		 175 aa  149  2e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.850149  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1190  3H domain-containing protein  44.31 
 
 		 173 aa  149  2e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000368504  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0107  3H  47.4 
 
 		 169 aa  144  8.000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.136307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3598  3H domain protein  44.71 
 
 		 169 aa  141  4e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2412  3H domain protein  42.11 
 
 		 174 aa  139  3e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.063026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0917  small molecule binding protein  41.82 
 
 		 171 aa  135  2e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000158366  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0638  3H domain-containing protein  45.45 
 
 		 163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.286476  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2341  3H domain protein  43.83 
 
 		 178 aa  131  5e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000864988  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0915  3H domain protein  40.59 
 
 		 179 aa  130  7.999999999999999e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3147  3H domain-containing protein  40.24 
 
 		 181 aa  129  3e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00899372  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2254  Helix-turn-helix type 11 domain protein  40 
 
 		 169 aa  128  3e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00454086 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0091  3H domain-containing protein  43.23 
 
 		 167 aa  127  6e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000249824  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1531  Helix-turn-helix type 11 domain protein  40.59 
 
 		 166 aa  126  2.0000000000000002e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000666791  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2533  3H domain protein  38.15 
 
 		 179 aa  124  5e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0685  hypothetical protein  40.24 
 
 		 180 aa  124  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0313179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1547  3H domain protein  42.6 
 
 		 191 aa  124  8.000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4664  hypothetical protein  40.24 
 
 		 180 aa  123  9e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4565  hypothetical protein  40.24 
 
 		 180 aa  123  9e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4550  hypothetical protein  40.24 
 
 		 180 aa  123  9e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000106281  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4512  hypothetical protein  40.24 
 
 		 180 aa  123  9e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.344056 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4177  transcriptional regulator  40.24 
 
 		 180 aa  123  9e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000502629  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4166  transcriptional regulator  40.24 
 
 		 180 aa  123  9e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4329  hypothetical protein  40.24 
 
 		 180 aa  123  9e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4517  hypothetical protein  40.24 
 
 		 180 aa  123  9e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4278  3H domain-containing protein  38.46 
 
 		 180 aa  122  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000110605  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1603  biotin repressor family transcriptional regulator  39.64 
 
 		 173 aa  110  7.000000000000001e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00245207  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2259  BglG family transcriptional antiterminator  30.77 
 
 		 623 aa  42.7  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2094  hypothetical protein  40.98 
 
 		 228 aa  40.8  0.01  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2105  hypothetical protein  40.98 
 
 		 228 aa  40.8  0.01  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>