35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0638 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0638  3H domain-containing protein  100 
 
 
163 aa  318  3e-86  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.286476  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0091  3H domain-containing protein  59.88 
 
 
167 aa  201  3e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000249824  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1265  3H domain-containing protein  57.5 
 
 
175 aa  181  4.0000000000000006e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.850149  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1190  3H domain-containing protein  57.5 
 
 
173 aa  181  4.0000000000000006e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000368504  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0475  3H domain-containing protein  50 
 
 
170 aa  151  2.9999999999999998e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000268079  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0107  3H  49.36 
 
 
169 aa  135  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.136307  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2412  3H domain protein  43.9 
 
 
174 aa  134  6.0000000000000005e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.063026  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3730  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  45.45 
 
 
170 aa  132  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000398262  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3598  3H domain protein  43.79 
 
 
169 aa  131  3.9999999999999996e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2254  Helix-turn-helix type 11 domain protein  37.35 
 
 
169 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00454086 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0917  small molecule binding protein  35.19 
 
 
171 aa  124  5e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000158366  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2341  3H domain protein  36.48 
 
 
178 aa  119  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000864988  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1547  3H domain protein  38.27 
 
 
191 aa  114  6e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0685  hypothetical protein  36.42 
 
 
180 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0313179  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4550  hypothetical protein  35.8 
 
 
180 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000106281  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4517  hypothetical protein  35.8 
 
 
180 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4329  hypothetical protein  35.8 
 
 
180 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4166  transcriptional regulator  35.8 
 
 
180 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4512  hypothetical protein  35.8 
 
 
180 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.344056 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4565  hypothetical protein  35.8 
 
 
180 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4177  transcriptional regulator  35.8 
 
 
180 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000502629  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4664  hypothetical protein  35.8 
 
 
180 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0915  3H domain protein  35.4 
 
 
179 aa  108  5e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3147  3H domain-containing protein  35.8 
 
 
181 aa  107  6e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00899372  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4278  3H domain-containing protein  35.8 
 
 
180 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000110605  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1603  biotin repressor family transcriptional regulator  34.78 
 
 
173 aa  107  9.000000000000001e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00245207  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2533  3H domain protein  36.42 
 
 
179 aa  106  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1531  Helix-turn-helix type 11 domain protein  37.5 
 
 
166 aa  101  4e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000666791  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1468  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  41.07 
 
 
329 aa  44.7  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0104  hypothetical protein  40 
 
 
230 aa  42.4  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3184  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  32.39 
 
 
326 aa  41.6  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1514  CBS domain-containing protein  30 
 
 
219 aa  41.2  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2105  hypothetical protein  38.33 
 
 
228 aa  40.8  0.008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1648  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  38.89 
 
 
326 aa  40.8  0.008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2094  hypothetical protein  38.33 
 
 
228 aa  40.8  0.008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>