28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1603 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG1603  biotin repressor family transcriptional regulator  100 
 
 
173 aa  355  1.9999999999999998e-97  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00245207  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0475  3H domain-containing protein  44.38 
 
 
170 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000268079  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3598  3H domain protein  44.77 
 
 
169 aa  137  6e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4166  transcriptional regulator  41.07 
 
 
180 aa  128  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4177  transcriptional regulator  41.07 
 
 
180 aa  128  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000502629  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4664  hypothetical protein  41.07 
 
 
180 aa  128  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3147  3H domain-containing protein  40.48 
 
 
181 aa  129  3e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00899372  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4512  hypothetical protein  41.07 
 
 
180 aa  128  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.344056 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4517  hypothetical protein  41.07 
 
 
180 aa  128  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4329  hypothetical protein  41.07 
 
 
180 aa  128  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4550  hypothetical protein  41.07 
 
 
180 aa  128  3e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000106281  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4565  hypothetical protein  41.07 
 
 
180 aa  128  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4278  3H domain-containing protein  40.48 
 
 
180 aa  128  5.0000000000000004e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000110605  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0685  hypothetical protein  40.48 
 
 
180 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0313179  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2533  3H domain protein  39.88 
 
 
179 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0915  3H domain protein  38.1 
 
 
179 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2341  3H domain protein  39.63 
 
 
178 aa  119  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000864988  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1265  3H domain-containing protein  37.72 
 
 
175 aa  119  3e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.850149  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1190  3H domain-containing protein  37.72 
 
 
173 aa  119  3e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000368504  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2254  Helix-turn-helix type 11 domain protein  37.58 
 
 
169 aa  118  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00454086 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2412  3H domain protein  40.7 
 
 
174 aa  118  4.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.063026  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0917  small molecule binding protein  38.69 
 
 
171 aa  117  9.999999999999999e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000158366  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1547  3H domain protein  36.69 
 
 
191 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0107  3H  37.65 
 
 
169 aa  112  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.136307  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3730  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  39.64 
 
 
170 aa  110  7.000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000398262  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0638  3H domain-containing protein  34.78 
 
 
163 aa  107  1e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.286476  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0091  3H domain-containing protein  34.57 
 
 
167 aa  99  3e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000249824  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1531  Helix-turn-helix type 11 domain protein  35.5 
 
 
166 aa  97.1  1e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000666791  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>