48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1531 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_1531  Helix-turn-helix type 11 domain protein  100 
 
 		 166 aa  329  1e-89  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000666791  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2412  3H domain protein  40.7 
 
 		 174 aa  128  3e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.063026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3730  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  40.59 
 
 		 170 aa  126  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000398262  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2341  3H domain protein  37.2 
 
 		 178 aa  124  4.0000000000000003e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000864988  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0475  3H domain-containing protein  38.82 
 
 		 170 aa  124  7e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000268079  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3598  3H domain protein  38.69 
 
 		 169 aa  120  9e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1265  3H domain-containing protein  36.14 
 
 		 175 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.850149  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1190  3H domain-containing protein  36.14 
 
 		 173 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000368504  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2254  Helix-turn-helix type 11 domain protein  35.54 
 
 		 169 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00454086 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0917  small molecule binding protein  36.75 
 
 		 171 aa  107  9.000000000000001e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000158366  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0091  3H domain-containing protein  39.19 
 
 		 167 aa  104  6e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000249824  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0638  3H domain-containing protein  37.5 
 
 		 163 aa  101  4e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.286476  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0107  3H  35.5 
 
 		 169 aa  101  6e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.136307  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2533  3H domain protein  37.87 
 
 		 179 aa  100  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3147  3H domain-containing protein  36.14 
 
 		 181 aa  97.8  6e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00899372  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1603  biotin repressor family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 173 aa  97.1  1e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00245207  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0915  3H domain protein  34.32 
 
 		 179 aa  96.3  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4512  hypothetical protein  34.94 
 
 		 180 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.344056 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4166  transcriptional regulator  34.94 
 
 		 180 aa  92.4  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4177  transcriptional regulator  34.94 
 
 		 180 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000502629  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4664  hypothetical protein  34.94 
 
 		 180 aa  92.4  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4329  hypothetical protein  34.94 
 
 		 180 aa  92.4  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4517  hypothetical protein  34.94 
 
 		 180 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4565  hypothetical protein  34.94 
 
 		 180 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4550  hypothetical protein  34.94 
 
 		 180 aa  92.4  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000106281  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4278  3H domain-containing protein  34.34 
 
 		 180 aa  91.7  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000110605  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0685  hypothetical protein  34.94 
 
 		 180 aa  91.3  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0313179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1547  3H domain protein  32.08 
 
 		 191 aa  85.9  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2418  CBS domain containing protein  33.33 
 
 		 209 aa  45.8  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12710  putative signal-transduction protein with CBS domains  37.29 
 
 		 210 aa  45.1  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2684  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  39.29 
 
 		 405 aa  44.7  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0888336  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1130  CBS domain-containing protein  36.92 
 
 		 207 aa  43.5  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.175486  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1607  putative signal transduction protein with CBS domains  29.7 
 
 		 238 aa  43.5  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.913702  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1588  biotin--(acetyl-COA-carboxylase) synthetase  39.39 
 
 		 326 aa  43.9  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.202289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4521  CBS domain-containing protein  34.38 
 
 		 210 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0249213  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4377  CBS domain-containing protein  34.38 
 
 		 210 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000965653  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4197  CBS domain-containing protein  34.38 
 
 		 210 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4035  CBS domain-containing protein  34.38 
 
 		 210 aa  42.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000408122  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4045  CBS domain-containing protein  34.38 
 
 		 210 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4430  CBS domain protein  34.38 
 
 		 210 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000580488  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1648  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  35.59 
 
 		 326 aa  42.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4319  CBS domain protein  34.38 
 
 		 210 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.88504e-59 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0822  CBS domain protein  34.38 
 
 		 210 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000129244  decreased coverage  1.04097e-22 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4414  CBS domain protein  34.38 
 
 		 210 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000209599  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4148  signal-transduction protein  34.38 
 
 		 211 aa  42  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.116745  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5970  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  29.36 
 
 		 241 aa  41.6  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.392838 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3646  Helix-turn-helix type 11 domain protein  34.62 
 
 		 230 aa  40.8  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5977  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.47 
 
 		 231 aa  40.4  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.374689  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>