58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1190 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_1190  3H domain-containing protein  100 
 
 		 173 aa  340  5e-93  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000368504  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1265  3H domain-containing protein  100 
 
 		 175 aa  340  5.999999999999999e-93  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.850149  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0638  3H domain-containing protein  57.5 
 
 		 163 aa  181  5.0000000000000004e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.286476  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0091  3H domain-containing protein  52.5 
 
 		 167 aa  171  5e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000249824  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0475  3H domain-containing protein  50.9 
 
 		 170 aa  170  9e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000268079  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2412  3H domain protein  47.06 
 
 		 174 aa  154  5.0000000000000005e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.063026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0107  3H  48.26 
 
 		 169 aa  151  4e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.136307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3598  3H domain protein  43.11 
 
 		 169 aa  150  1e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3730  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  44.31 
 
 		 170 aa  149  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000398262  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2254  Helix-turn-helix type 11 domain protein  42.42 
 
 		 169 aa  142  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00454086 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0917  small molecule binding protein  37.5 
 
 		 171 aa  133  9.999999999999999e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000158366  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1547  3H domain protein  44.71 
 
 		 191 aa  131  5e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2533  3H domain protein  41.04 
 
 		 179 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0915  3H domain protein  42.2 
 
 		 179 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0685  hypothetical protein  37.79 
 
 		 180 aa  121  6e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0313179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3147  3H domain-containing protein  37.21 
 
 		 181 aa  120  7e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00899372  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4512  hypothetical protein  37.79 
 
 		 180 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.344056 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4565  hypothetical protein  37.79 
 
 		 180 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4664  hypothetical protein  37.79 
 
 		 180 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2341  3H domain protein  39.41 
 
 		 178 aa  120  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000864988  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4177  transcriptional regulator  37.79 
 
 		 180 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000502629  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4166  transcriptional regulator  37.79 
 
 		 180 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4329  hypothetical protein  37.79 
 
 		 180 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4517  hypothetical protein  37.79 
 
 		 180 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4550  hypothetical protein  37.79 
 
 		 180 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000106281  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1603  biotin repressor family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 173 aa  119  3e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00245207  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4278  3H domain-containing protein  37.21 
 
 		 180 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000110605  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1531  Helix-turn-helix type 11 domain protein  36.14 
 
 		 166 aa  111  5e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000666791  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0104  hypothetical protein  46.77 
 
 		 230 aa  50.1  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0831  transcriptional regulator-like  46.03 
 
 		 244 aa  49.3  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0455803 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2094  hypothetical protein  45.16 
 
 		 228 aa  47.8  0.00007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2105  hypothetical protein  45.16 
 
 		 228 aa  47.8  0.00007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5970  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  41.94 
 
 		 241 aa  48.1  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.392838 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3821  hypothetical protein  40 
 
 		 232 aa  47.8  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0663  BirA bifunctional protein  46.77 
 
 		 328 aa  47.8  0.00009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0814484  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0664  BirA bifunctional protein  50.91 
 
 		 328 aa  47.4  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.06678  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5977  Helix-turn-helix type 11 domain protein  38.1 
 
 		 231 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.374689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3184  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  46.15 
 
 		 326 aa  46.6  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1583  hypothetical protein  41.27 
 
 		 234 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.906124  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1871  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  48.21 
 
 		 332 aa  46.2  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000312804  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2089  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  43.4 
 
 		 237 aa  44.7  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.641654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0369  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  42.86 
 
 		 229 aa  44.3  0.0008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.189659 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2817  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  37.78 
 
 		 336 aa  44.3  0.0009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000210207  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0532  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  41.94 
 
 		 231 aa  43.5  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04135  transcriptional regulator  44.19 
 
 		 321 aa  43.5  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.292788  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4305  Helix-turn-helix type 11 domain protein  42.37 
 
 		 233 aa  43.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3646  Helix-turn-helix type 11 domain protein  41.94 
 
 		 230 aa  43.5  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1648  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  41.3 
 
 		 326 aa  42  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2934  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  39.68 
 
 		 230 aa  42  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.334283 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0282  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  47.62 
 
 		 231 aa  42  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2669  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  47.73 
 
 		 312 aa  41.6  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1219  transcriptional regulator  29.21 
 
 		 336 aa  42  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2779  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  43.55 
 
 		 325 aa  42  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0162859  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1081  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  38.71 
 
 		 315 aa  41.2  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.560256  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2626  helix-turn-helix, type 11  39.68 
 
 		 230 aa  41.2  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.182787  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2670  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  39.68 
 
 		 230 aa  41.2  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.750457  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3900  Helix-turn-helix type 11 domain protein  41.94 
 
 		 230 aa  41.2  0.008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.543885  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2610  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  34.55 
 
 		 335 aa  40.8  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.808481 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>