28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2533 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2533  3H domain protein  100 
 
 
179 aa  368  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0915  3H domain protein  87.71 
 
 
179 aa  326  9e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3147  3H domain-containing protein  71.75 
 
 
181 aa  273  7e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00899372  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4550  hypothetical protein  72.57 
 
 
180 aa  271  3e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000106281  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4517  hypothetical protein  72 
 
 
180 aa  270  1e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4565  hypothetical protein  72 
 
 
180 aa  270  1e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0685  hypothetical protein  72 
 
 
180 aa  269  1e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0313179  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4512  hypothetical protein  72 
 
 
180 aa  270  1e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.344056 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4664  hypothetical protein  72 
 
 
180 aa  270  1e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4177  transcriptional regulator  72 
 
 
180 aa  270  1e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000502629  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4166  transcriptional regulator  72 
 
 
180 aa  270  1e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4329  hypothetical protein  72 
 
 
180 aa  270  1e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4278  3H domain-containing protein  70.29 
 
 
180 aa  266  1e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000110605  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0475  3H domain-containing protein  43.79 
 
 
170 aa  148  4e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000268079  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2341  3H domain protein  42.77 
 
 
178 aa  142  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000864988  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2254  Helix-turn-helix type 11 domain protein  43.79 
 
 
169 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00454086 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1547  3H domain protein  41.76 
 
 
191 aa  137  6e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2412  3H domain protein  44.05 
 
 
174 aa  135  3.0000000000000003e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.063026  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1265  3H domain-containing protein  41.04 
 
 
175 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.850149  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1190  3H domain-containing protein  41.04 
 
 
173 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000368504  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3598  3H domain protein  40.83 
 
 
169 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0107  3H  43.53 
 
 
169 aa  126  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.136307  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1603  biotin repressor family transcriptional regulator  39.88 
 
 
173 aa  126  2.0000000000000002e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00245207  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3730  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  38.15 
 
 
170 aa  124  6e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000398262  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0917  small molecule binding protein  36.9 
 
 
171 aa  119  1.9999999999999998e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000158366  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0638  3H domain-containing protein  36.42 
 
 
163 aa  106  2e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.286476  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0091  3H domain-containing protein  34.97 
 
 
167 aa  102  3e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000249824  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1531  Helix-turn-helix type 11 domain protein  37.87 
 
 
166 aa  100  2e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000666791  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>