33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1900 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1900  putative lipoprotein  100 
 
 		 106 aa  206  1e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1346  hypothetical protein  90.57 
 
 		 106 aa  162  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.138506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3701  putative lipoprotein  93.4 
 
 		 106 aa  143  6e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.11036  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1555  hypothetical protein  84.55 
 
 		 110 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00010452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1321  putative lipoprotein  89.09 
 
 		 110 aa  124  3e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2579  lipoprotein  75.45 
 
 		 108 aa  122  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1287  putative lipoprotein  73.58 
 
 		 105 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0731  putative lipoprotein  73.33 
 
 		 104 aa  105  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2355  putative lipoprotein  81.93 
 
 		 100 aa  103  7e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0256577  normal  0.327149 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35670  lipoprotein  76 
 
 		 100 aa  100  6e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2009  putative lipoprotein  81.01 
 
 		 110 aa  98.6  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.152264  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2906  putative lipoprotein  54.55 
 
 		 107 aa  85.5  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2694  putative lipoprotein  49.02 
 
 		 108 aa  85.1  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.291248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3501  putative lipoprotein  53.85 
 
 		 102 aa  82  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0433  putative lipoprotein  53.19 
 
 		 99 aa  77.8  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.79631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4192  hypothetical protein  45.59 
 
 		 80 aa  57  0.00000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.724934 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0809  hypothetical protein  39.71 
 
 		 104 aa  57  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.910435  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35750  lipoprotein  43.06 
 
 		 88 aa  56.2  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2347  putative lipoprotein  45.71 
 
 		 88 aa  53.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.629232 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0441  hypothetical protein  44.44 
 
 		 72 aa  52.4  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2063  putative lipoprotein  43.75 
 
 		 87 aa  51.6  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.054881  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3509  hypothetical protein  44.62 
 
 		 75 aa  51.2  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1279  putative lipoprotein  43.24 
 
 		 87 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2915  putative lipoprotein  39.19 
 
 		 92 aa  48.9  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3709  putative lipoprotein  40 
 
 		 87 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.190122  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2001  putative lipoprotein  42.86 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1547  hypothetical protein  42.25 
 
 		 92 aa  49.3  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00175171  normal  0.932168 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3722  putative lipoprotein  38.75 
 
 		 92 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2587  lipoprotein  47.92 
 
 		 87 aa  47.4  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1892  putative lipoprotein  50 
 
 		 92 aa  45.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35840  lipoprotein  43.94 
 
 		 87 aa  45.1  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.300503  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1337  hypothetical protein  43.75 
 
 		 92 aa  43.9  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0469662  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0723  putative lipoprotein  42.37 
 
 		 88 aa  42  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>