30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0731 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_0731  putative lipoprotein  100 
 
 		 104 aa  202  2e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2579  lipoprotein  74.04 
 
 		 108 aa  120  5e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1346  hypothetical protein  71.59 
 
 		 106 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.138506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1287  putative lipoprotein  71.88 
 
 		 105 aa  107  5e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1900  putative lipoprotein  73.33 
 
 		 106 aa  92  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3701  putative lipoprotein  72.22 
 
 		 106 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.11036  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35670  lipoprotein  71.28 
 
 		 100 aa  89.4  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2355  putative lipoprotein  67.9 
 
 		 100 aa  86.3  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0256577  normal  0.327149 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1555  hypothetical protein  68.09 
 
 		 110 aa  82.8  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00010452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2009  putative lipoprotein  67.95 
 
 		 110 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.152264  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1321  putative lipoprotein  69.15 
 
 		 110 aa  78.6  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2906  putative lipoprotein  47.52 
 
 		 107 aa  73.9  0.0000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0433  putative lipoprotein  51.96 
 
 		 99 aa  72.4  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.79631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3501  putative lipoprotein  51.25 
 
 		 102 aa  69.3  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2694  putative lipoprotein  45.45 
 
 		 108 aa  67  0.00000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.291248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4192  hypothetical protein  42.86 
 
 		 80 aa  51.6  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.724934 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3709  putative lipoprotein  37.93 
 
 		 87 aa  47  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.190122  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1547  hypothetical protein  41.77 
 
 		 92 aa  46.2  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00175171  normal  0.932168 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0809  hypothetical protein  34.85 
 
 		 104 aa  45.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.910435  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0441  hypothetical protein  42.19 
 
 		 72 aa  45.4  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2347  putative lipoprotein  39.73 
 
 		 88 aa  45.1  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.629232 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2063  putative lipoprotein  35.71 
 
 		 87 aa  44.3  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.054881  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1892  putative lipoprotein  36.71 
 
 		 92 aa  44.3  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3509  hypothetical protein  40.91 
 
 		 75 aa  43.9  0.0008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35750  lipoprotein  38.03 
 
 		 88 aa  43.5  0.0009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2915  putative lipoprotein  37.97 
 
 		 92 aa  43.5  0.0009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2001  putative lipoprotein  39.73 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2587  lipoprotein  50 
 
 		 87 aa  41.2  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3722  putative lipoprotein  33.33 
 
 		 92 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1279  putative lipoprotein  41.67 
 
 		 87 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>