18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0433 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_0433  putative lipoprotein  100 
 
 
99 aa  197  3e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.79631  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2694  putative lipoprotein  68.52 
 
 
108 aa  143  7.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.291248  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3501  putative lipoprotein  66.67 
 
 
102 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2906  putative lipoprotein  63.55 
 
 
107 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2579  lipoprotein  53.15 
 
 
108 aa  73.9  0.0000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1346  hypothetical protein  47.12 
 
 
106 aa  68.2  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.138506  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2009  putative lipoprotein  55.42 
 
 
110 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.152264  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3701  putative lipoprotein  48.54 
 
 
106 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.11036  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0731  putative lipoprotein  56 
 
 
104 aa  61.6  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2355  putative lipoprotein  59.15 
 
 
100 aa  62  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0256577  normal  0.327149 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1321  putative lipoprotein  61.19 
 
 
110 aa  61.6  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1555  hypothetical protein  47.71 
 
 
110 aa  61.6  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00010452  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35670  lipoprotein  58.33 
 
 
100 aa  59.7  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1287  putative lipoprotein  48.11 
 
 
105 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1900  putative lipoprotein  50 
 
 
106 aa  58.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35840  lipoprotein  41.67 
 
 
87 aa  43.9  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.300503  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4192  hypothetical protein  39.06 
 
 
80 aa  41.2  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.724934 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2347  putative lipoprotein  37.18 
 
 
88 aa  41.2  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.629232 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>