25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1555 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1555  hypothetical protein  100 
 
 		 110 aa  216  7.999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00010452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1346  hypothetical protein  81.82 
 
 		 106 aa  150  8e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.138506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3701  putative lipoprotein  85.45 
 
 		 106 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.11036  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1900  putative lipoprotein  84.55 
 
 		 106 aa  126  9.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2579  lipoprotein  71.05 
 
 		 108 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1321  putative lipoprotein  81.58 
 
 		 110 aa  111  3e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1287  putative lipoprotein  69.09 
 
 		 105 aa  107  5e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0731  putative lipoprotein  68.09 
 
 		 104 aa  94.7  4e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2355  putative lipoprotein  74.71 
 
 		 100 aa  92  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0256577  normal  0.327149 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35670  lipoprotein  71.15 
 
 		 100 aa  89.7  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2009  putative lipoprotein  68.04 
 
 		 110 aa  89.4  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.152264  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2906  putative lipoprotein  54.81 
 
 		 107 aa  86.7  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2694  putative lipoprotein  51.43 
 
 		 108 aa  86.7  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.291248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3501  putative lipoprotein  51.96 
 
 		 102 aa  84.3  6e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0433  putative lipoprotein  50.46 
 
 		 99 aa  81.3  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.79631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0809  hypothetical protein  36.11 
 
 		 104 aa  48.5  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.910435  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4192  hypothetical protein  40.28 
 
 		 80 aa  47.4  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.724934 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35750  lipoprotein  38.16 
 
 		 88 aa  46.2  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0441  hypothetical protein  37.88 
 
 		 72 aa  44.7  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1279  putative lipoprotein  41.89 
 
 		 87 aa  44.3  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2063  putative lipoprotein  39.13 
 
 		 87 aa  44.3  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.054881  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2347  putative lipoprotein  40.54 
 
 		 88 aa  43.9  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.629232 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3509  hypothetical protein  38.24 
 
 		 75 aa  43.5  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2001  putative lipoprotein  39.19 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1547  hypothetical protein  36.9 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00175171  normal  0.932168 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>