29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4192 on replicon NC_008757
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008757  Pnap_4192  hypothetical protein  100 
 
 		 80 aa  164  2.9999999999999998e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.724934 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0809  hypothetical protein  66.67 
 
 		 104 aa  102  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.910435  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1547  hypothetical protein  63.53 
 
 		 92 aa  99.4  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00175171  normal  0.932168 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2915  putative lipoprotein  62.35 
 
 		 92 aa  99  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1892  putative lipoprotein  61.18 
 
 		 92 aa  97.4  5e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3709  putative lipoprotein  64.29 
 
 		 87 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.190122  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3722  putative lipoprotein  60.67 
 
 		 92 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2347  putative lipoprotein  61.9 
 
 		 88 aa  95.5  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.629232 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1279  putative lipoprotein  60.47 
 
 		 87 aa  94  6e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1337  hypothetical protein  60 
 
 		 92 aa  92.4  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0469662  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2063  putative lipoprotein  61.25 
 
 		 87 aa  92.4  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.054881  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2001  putative lipoprotein  61.25 
 
 		 88 aa  91.7  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35750  lipoprotein  57.83 
 
 		 88 aa  87.8  4e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2587  lipoprotein  63.1 
 
 		 87 aa  84.7  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3509  hypothetical protein  55.88 
 
 		 75 aa  82  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0441  hypothetical protein  59.68 
 
 		 72 aa  80.1  0.000000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35840  lipoprotein  54.67 
 
 		 87 aa  78.6  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.300503  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0723  putative lipoprotein  60 
 
 		 88 aa  77  0.00000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1315  hypothetical protein  55.88 
 
 		 75 aa  70.9  0.000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2642  hypothetical protein  50.72 
 
 		 76 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0332  putative lipoprotein  54.9 
 
 		 59 aa  50.4  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.907733  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1287  putative lipoprotein  51.06 
 
 		 105 aa  50.4  0.000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2579  lipoprotein  50 
 
 		 108 aa  50.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2702  putative lipoprotein  54.55 
 
 		 51 aa  47.8  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.686876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1346  hypothetical protein  42.65 
 
 		 106 aa  45.4  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.138506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2906  putative lipoprotein  41.38 
 
 		 107 aa  43.9  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0433  putative lipoprotein  39.06 
 
 		 99 aa  41.2  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.79631  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35670  lipoprotein  50 
 
 		 100 aa  41.2  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2009  putative lipoprotein  48.78 
 
 		 110 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.152264  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>