33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2009 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_2009  putative lipoprotein  100 
 
 		 110 aa  213  5.9999999999999996e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.152264  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2355  putative lipoprotein  92.55 
 
 		 100 aa  120  7e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0256577  normal  0.327149 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2579  lipoprotein  73.21 
 
 		 108 aa  114  6e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1346  hypothetical protein  66.36 
 
 		 106 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.138506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1287  putative lipoprotein  70 
 
 		 105 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35670  lipoprotein  73.64 
 
 		 100 aa  104  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1900  putative lipoprotein  76.04 
 
 		 106 aa  94.7  4e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3701  putative lipoprotein  69.09 
 
 		 106 aa  94  7e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.11036  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0731  putative lipoprotein  62.77 
 
 		 104 aa  93.6  8e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2694  putative lipoprotein  50 
 
 		 108 aa  92  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.291248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2906  putative lipoprotein  53.47 
 
 		 107 aa  88.6  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1321  putative lipoprotein  69.09 
 
 		 110 aa  87  7e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1555  hypothetical protein  64.91 
 
 		 110 aa  85.9  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00010452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0433  putative lipoprotein  51.82 
 
 		 99 aa  84.3  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.79631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3501  putative lipoprotein  47.71 
 
 		 102 aa  79.3  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0809  hypothetical protein  40.85 
 
 		 104 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.910435  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4192  hypothetical protein  42.86 
 
 		 80 aa  57.4  0.00000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.724934 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2347  putative lipoprotein  47.14 
 
 		 88 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.629232 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2001  putative lipoprotein  47.14 
 
 		 88 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35750  lipoprotein  42.86 
 
 		 88 aa  53.1  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0441  hypothetical protein  45 
 
 		 72 aa  53.5  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2063  putative lipoprotein  44.62 
 
 		 87 aa  53.5  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.054881  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3509  hypothetical protein  47.46 
 
 		 75 aa  52.8  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1547  hypothetical protein  44 
 
 		 92 aa  52.4  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00175171  normal  0.932168 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3722  putative lipoprotein  40 
 
 		 92 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1892  putative lipoprotein  41.43 
 
 		 92 aa  48.9  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3709  putative lipoprotein  39.51 
 
 		 87 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.190122  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1279  putative lipoprotein  43.48 
 
 		 87 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2915  putative lipoprotein  38.67 
 
 		 92 aa  47.8  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1337  hypothetical protein  37.33 
 
 		 92 aa  46.2  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0469662  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35840  lipoprotein  40 
 
 		 87 aa  45.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.300503  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2587  lipoprotein  40.91 
 
 		 87 aa  46.2  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0723  putative lipoprotein  40.91 
 
 		 88 aa  43.5  0.0009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>