15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2694 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_2694  putative lipoprotein  100 
 
 
108 aa  216  7.999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.291248  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3501  putative lipoprotein  84.26 
 
 
102 aa  178  2.9999999999999997e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0433  putative lipoprotein  68.52 
 
 
99 aa  143  7.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.79631  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2906  putative lipoprotein  64.86 
 
 
107 aa  128  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1346  hypothetical protein  48.04 
 
 
106 aa  76.3  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.138506  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2009  putative lipoprotein  58.14 
 
 
110 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.152264  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1555  hypothetical protein  49.54 
 
 
110 aa  69.7  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00010452  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3701  putative lipoprotein  53.12 
 
 
106 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.11036  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1321  putative lipoprotein  59.21 
 
 
110 aa  69.7  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1900  putative lipoprotein  49.02 
 
 
106 aa  68.6  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2579  lipoprotein  44.74 
 
 
108 aa  66.2  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2355  putative lipoprotein  56.16 
 
 
100 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0256577  normal  0.327149 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0731  putative lipoprotein  45.98 
 
 
104 aa  61.2  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35670  lipoprotein  54.29 
 
 
100 aa  59.7  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1287  putative lipoprotein  43.82 
 
 
105 aa  54.3  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>