15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_3501 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_3501  putative lipoprotein  100 
 
 		 102 aa  201  3e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2694  putative lipoprotein  84.26 
 
 		 108 aa  178  2.9999999999999997e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.291248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0433  putative lipoprotein  66.67 
 
 		 99 aa  125  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.79631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2906  putative lipoprotein  60.36 
 
 		 107 aa  107  5e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1346  hypothetical protein  49.02 
 
 		 106 aa  70.5  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.138506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1555  hypothetical protein  50.94 
 
 		 110 aa  66.2  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00010452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2009  putative lipoprotein  56.63 
 
 		 110 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.152264  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3701  putative lipoprotein  54.26 
 
 		 106 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.11036  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2579  lipoprotein  50 
 
 		 108 aa  63.5  0.0000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1321  putative lipoprotein  63.08 
 
 		 110 aa  62.4  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1900  putative lipoprotein  53.85 
 
 		 106 aa  61.2  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2355  putative lipoprotein  56.16 
 
 		 100 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0256577  normal  0.327149 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0731  putative lipoprotein  49.3 
 
 		 104 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1287  putative lipoprotein  44.94 
 
 		 105 aa  55.5  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35670  lipoprotein  55.22 
 
 		 100 aa  55.5  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>