33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3701 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3701  putative lipoprotein  100 
 
 
106 aa  205  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.11036  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1346  hypothetical protein  90.57 
 
 
106 aa  167  6e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.138506  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1900  putative lipoprotein  93.4 
 
 
106 aa  144  6e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1555  hypothetical protein  85.45 
 
 
110 aa  131  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00010452  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1321  putative lipoprotein  90.91 
 
 
110 aa  129  1.0000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2579  lipoprotein  73.64 
 
 
108 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1287  putative lipoprotein  71.7 
 
 
105 aa  118  3e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0731  putative lipoprotein  72.22 
 
 
104 aa  105  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2355  putative lipoprotein  79.52 
 
 
100 aa  100  6e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0256577  normal  0.327149 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35670  lipoprotein  75 
 
 
100 aa  99.8  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2009  putative lipoprotein  79.75 
 
 
110 aa  97.1  7e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.152264  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2694  putative lipoprotein  53.12 
 
 
108 aa  86.3  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.291248  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2906  putative lipoprotein  55 
 
 
107 aa  85.9  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3501  putative lipoprotein  58.82 
 
 
102 aa  83.6  8e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0433  putative lipoprotein  51.46 
 
 
99 aa  82  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.79631  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0809  hypothetical protein  42.65 
 
 
104 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.910435  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4192  hypothetical protein  44.12 
 
 
80 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.724934 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1279  putative lipoprotein  45.95 
 
 
87 aa  54.3  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0441  hypothetical protein  43.55 
 
 
72 aa  54.7  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35750  lipoprotein  40.28 
 
 
88 aa  53.1  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3722  putative lipoprotein  36.46 
 
 
92 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2915  putative lipoprotein  40.54 
 
 
92 aa  51.6  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3509  hypothetical protein  42.19 
 
 
75 aa  51.6  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2347  putative lipoprotein  44.44 
 
 
88 aa  50.8  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.629232 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2063  putative lipoprotein  40 
 
 
87 aa  49.7  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.054881  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1547  hypothetical protein  42.25 
 
 
92 aa  48.5  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00175171  normal  0.932168 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35840  lipoprotein  38.57 
 
 
87 aa  48.1  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.300503  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3709  putative lipoprotein  36.05 
 
 
87 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.190122  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2587  lipoprotein  47.92 
 
 
87 aa  47.4  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1892  putative lipoprotein  34.67 
 
 
92 aa  47  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2001  putative lipoprotein  41.67 
 
 
88 aa  47  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1337  hypothetical protein  37.5 
 
 
92 aa  47  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0469662  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0723  putative lipoprotein  40.91 
 
 
88 aa  44.3  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>