19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4455 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_4455  hypothetical protein  100 
 
 
367 aa  758    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4871  hypothetical protein  61.85 
 
 
360 aa  491  1e-137  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.362055  hitchhiker  0.00000195031 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1305  hypothetical protein  62.57 
 
 
361 aa  489  1e-137  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5006  hypothetical protein  60.94 
 
 
363 aa  483  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2956  hypothetical protein  59.56 
 
 
358 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.962807  normal  0.106975 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3162  hypothetical protein  59.56 
 
 
358 aa  468  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2408  hypothetical protein  59.95 
 
 
358 aa  453  1.0000000000000001e-126  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2598  hypothetical protein  47.8 
 
 
358 aa  362  6e-99  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15611  hypothetical protein  32.87 
 
 
358 aa  186  4e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.781392 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1454  hypothetical protein  30.81 
 
 
361 aa  177  2e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0672806 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1046  hypothetical protein  32.12 
 
 
360 aa  167  2.9999999999999998e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.00909472  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0798  Smr protein/MutS2  25.07 
 
 
486 aa  126  7e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.475596 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1833  hypothetical protein  25.62 
 
 
360 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3151  hypothetical protein  24.84 
 
 
365 aa  80.9  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00501753 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2128  hypothetical protein  23.1 
 
 
363 aa  80.1  0.00000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.777089  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0422  hypothetical protein  18.94 
 
 
381 aa  66.6  0.0000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.660011 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0175  hypothetical protein  22.51 
 
 
358 aa  65.1  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.103811  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0092  hypothetical protein  22.22 
 
 
366 aa  63.2  0.000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1671  hypothetical protein  22.77 
 
 
381 aa  55.1  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.670148  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>