20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4871 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_4871  hypothetical protein  100 
 
 
360 aa  745    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.362055  hitchhiker  0.00000195031 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2408  hypothetical protein  75.98 
 
 
358 aa  538  9.999999999999999e-153  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1305  hypothetical protein  65.55 
 
 
361 aa  504  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2956  hypothetical protein  63.87 
 
 
358 aa  492  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.962807  normal  0.106975 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4455  hypothetical protein  61.85 
 
 
367 aa  491  1e-137  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3162  hypothetical protein  63.59 
 
 
358 aa  489  1e-137  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5006  hypothetical protein  63.35 
 
 
363 aa  474  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2598  hypothetical protein  54.78 
 
 
358 aa  385  1e-106  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15611  hypothetical protein  33.43 
 
 
358 aa  185  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.781392 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1454  hypothetical protein  33.52 
 
 
361 aa  175  9.999999999999999e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0672806 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1046  hypothetical protein  33.81 
 
 
360 aa  168  1e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.00909472  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0798  Smr protein/MutS2  28.21 
 
 
486 aa  154  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.475596 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2128  hypothetical protein  25.75 
 
 
363 aa  102  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.777089  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1833  hypothetical protein  25.91 
 
 
360 aa  92.4  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3151  hypothetical protein  25.28 
 
 
365 aa  89  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00501753 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0422  hypothetical protein  20.97 
 
 
381 aa  86.3  7e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.660011 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0175  hypothetical protein  23.16 
 
 
358 aa  80.9  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.103811  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1671  hypothetical protein  22.68 
 
 
381 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.670148  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0092  hypothetical protein  21.61 
 
 
366 aa  71.2  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1235  teichoic acid biosynthesis related protein  27.69 
 
 
360 aa  43.5  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>