18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1671 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1671  hypothetical protein  100 
 
 		 381 aa  743    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.670148  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0422  hypothetical protein  35.92 
 
 		 381 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.660011 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0175  hypothetical protein  34.06 
 
 		 358 aa  164  3e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.103811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3151  hypothetical protein  31.68 
 
 		 365 aa  124  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00501753 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0092  hypothetical protein  25.85 
 
 		 366 aa  124  4e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0798  Smr protein/MutS2  25.07 
 
 		 486 aa  90.5  5e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.475596 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4871  hypothetical protein  22.68 
 
 		 360 aa  85.5  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.362055  hitchhiker  0.00000195031 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1833  hypothetical protein  21.94 
 
 		 360 aa  69.3  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1305  hypothetical protein  21.64 
 
 		 361 aa  66.6  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2408  hypothetical protein  22.34 
 
 		 358 aa  62.8  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5006  hypothetical protein  23.78 
 
 		 363 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2956  hypothetical protein  23 
 
 		 358 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.962807  normal  0.106975 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4455  hypothetical protein  22.77 
 
 		 367 aa  60.8  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3162  hypothetical protein  22.68 
 
 		 358 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2598  hypothetical protein  22.47 
 
 		 358 aa  58.9  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1454  hypothetical protein  27.47 
 
 		 361 aa  58.9  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0672806 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2128  hypothetical protein  24.02 
 
 		 363 aa  56.6  0.0000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.777089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15611  hypothetical protein  24.04 
 
 		 358 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.781392 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>