20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1833 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_1833  hypothetical protein  100 
 
 
360 aa  746    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0798  Smr protein/MutS2  26.76 
 
 
486 aa  127  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.475596 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2598  hypothetical protein  27 
 
 
358 aa  121  1.9999999999999998e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1305  hypothetical protein  28.07 
 
 
361 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4455  hypothetical protein  25.62 
 
 
367 aa  115  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5006  hypothetical protein  29.35 
 
 
363 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3151  hypothetical protein  25.35 
 
 
365 aa  112  7.000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00501753 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0422  hypothetical protein  24.09 
 
 
381 aa  99.4  8e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.660011 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2128  hypothetical protein  25.07 
 
 
363 aa  97.8  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.777089  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2408  hypothetical protein  25.92 
 
 
358 aa  95.1  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2956  hypothetical protein  24.86 
 
 
358 aa  94  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.962807  normal  0.106975 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3162  hypothetical protein  24.86 
 
 
358 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4871  hypothetical protein  25.91 
 
 
360 aa  92.4  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.362055  hitchhiker  0.00000195031 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1046  hypothetical protein  25.94 
 
 
360 aa  85.5  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.00909472  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1454  hypothetical protein  25.27 
 
 
361 aa  83.6  0.000000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0672806 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15611  hypothetical protein  25.66 
 
 
358 aa  82.8  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.781392 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0092  hypothetical protein  25.34 
 
 
366 aa  77.4  0.0000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1671  hypothetical protein  21.94 
 
 
381 aa  61.6  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.670148  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0194  glycosyltransferase family 28 protein  24 
 
 
340 aa  49.3  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.775118 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119506  Monogalactosyldiacylglycerol (MGDG) synthase  27.82 
 
 
501 aa  46.2  0.0009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>