19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2598 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2598  hypothetical protein  100 
 
 
358 aa  731    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1305  hypothetical protein  54.37 
 
 
361 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4871  hypothetical protein  54.78 
 
 
360 aa  397  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.362055  hitchhiker  0.00000195031 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5006  hypothetical protein  56.66 
 
 
363 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2956  hypothetical protein  50.71 
 
 
358 aa  383  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.962807  normal  0.106975 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3162  hypothetical protein  50.71 
 
 
358 aa  382  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4455  hypothetical protein  47.8 
 
 
367 aa  370  1e-101  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2408  hypothetical protein  51.12 
 
 
358 aa  346  3e-94  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15611  hypothetical protein  35.57 
 
 
358 aa  190  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.781392 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1454  hypothetical protein  36.8 
 
 
361 aa  181  2e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0672806 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1046  hypothetical protein  34.01 
 
 
360 aa  150  3e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.00909472  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0798  Smr protein/MutS2  30.5 
 
 
486 aa  147  3e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.475596 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1833  hypothetical protein  25.48 
 
 
360 aa  123  6e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2128  hypothetical protein  25.76 
 
 
363 aa  94.7  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.777089  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0092  hypothetical protein  24.16 
 
 
366 aa  91.7  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0422  hypothetical protein  25.89 
 
 
381 aa  85.9  9e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.660011 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3151  hypothetical protein  26.46 
 
 
365 aa  82.4  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00501753 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0175  hypothetical protein  26.11 
 
 
358 aa  73.2  0.000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.103811  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1671  hypothetical protein  22.47 
 
 
381 aa  51.2  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.670148  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>