21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2128 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_2128  hypothetical protein  100 
 
 
363 aa  733    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.777089  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0798  Smr protein/MutS2  28.83 
 
 
486 aa  112  9e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.475596 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4871  hypothetical protein  25.75 
 
 
360 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.362055  hitchhiker  0.00000195031 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1833  hypothetical protein  25.07 
 
 
360 aa  97.8  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2598  hypothetical protein  26.37 
 
 
358 aa  95.1  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2408  hypothetical protein  26.27 
 
 
358 aa  91.3  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2956  hypothetical protein  24.32 
 
 
358 aa  90.1  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.962807  normal  0.106975 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3162  hypothetical protein  24.02 
 
 
358 aa  87  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5006  hypothetical protein  23.93 
 
 
363 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1305  hypothetical protein  23.56 
 
 
361 aa  84  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3151  hypothetical protein  27.82 
 
 
365 aa  82.8  0.000000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00501753 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1454  hypothetical protein  28.31 
 
 
361 aa  80.9  0.00000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0672806 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4455  hypothetical protein  23.1 
 
 
367 aa  80.1  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0422  hypothetical protein  22.96 
 
 
381 aa  64.3  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.660011 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1671  hypothetical protein  24.02 
 
 
381 aa  55.8  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.670148  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1046  hypothetical protein  25 
 
 
360 aa  55.8  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.00909472  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0092  hypothetical protein  23.42 
 
 
366 aa  55.1  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15611  hypothetical protein  23.56 
 
 
358 aa  53.9  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.781392 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0175  hypothetical protein  22.15 
 
 
358 aa  50.1  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.103811  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0194  glycosyltransferase family 28 protein  21.27 
 
 
340 aa  48.5  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.775118 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4035  glycosyl transferase family protein  41.41 
 
 
432 aa  45.1  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.996814  normal  0.480541 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>