19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0175 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_0175  hypothetical protein  100 
 
 
358 aa  729    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.103811  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0422  hypothetical protein  43.84 
 
 
381 aa  271  1e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.660011 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0092  hypothetical protein  32.05 
 
 
366 aa  180  2.9999999999999997e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1671  hypothetical protein  34.06 
 
 
381 aa  169  7e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.670148  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0798  Smr protein/MutS2  24.55 
 
 
486 aa  108  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.475596 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3151  hypothetical protein  26.89 
 
 
365 aa  103  6e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00501753 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4871  hypothetical protein  23.16 
 
 
360 aa  94.7  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.362055  hitchhiker  0.00000195031 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1305  hypothetical protein  23.1 
 
 
361 aa  93.6  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2956  hypothetical protein  24.26 
 
 
358 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.962807  normal  0.106975 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2408  hypothetical protein  24.43 
 
 
358 aa  89.7  6e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3162  hypothetical protein  23.93 
 
 
358 aa  89.7  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2598  hypothetical protein  25 
 
 
358 aa  82  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5006  hypothetical protein  23.27 
 
 
363 aa  80.5  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1454  hypothetical protein  26.96 
 
 
361 aa  73.9  0.000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0672806 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4455  hypothetical protein  22.51 
 
 
367 aa  73.2  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15611  hypothetical protein  24.18 
 
 
358 aa  72  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.781392 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2128  hypothetical protein  22.15 
 
 
363 aa  65.9  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.777089  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1046  hypothetical protein  26.49 
 
 
360 aa  57  0.0000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.00909472  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1833  hypothetical protein  22.67 
 
 
360 aa  55.8  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>