19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1305 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1305  hypothetical protein  100 
 
 
361 aa  747    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2956  hypothetical protein  69.27 
 
 
358 aa  544  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.962807  normal  0.106975 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3162  hypothetical protein  69.27 
 
 
358 aa  543  1e-153  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4871  hypothetical protein  65.55 
 
 
360 aa  504  9.999999999999999e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.362055  hitchhiker  0.00000195031 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4455  hypothetical protein  62.57 
 
 
367 aa  489  1e-137  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5006  hypothetical protein  62.22 
 
 
363 aa  466  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2408  hypothetical protein  63.59 
 
 
358 aa  463  1e-129  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2598  hypothetical protein  54.37 
 
 
358 aa  391  1e-107  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15611  hypothetical protein  33.15 
 
 
358 aa  179  7e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.781392 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1454  hypothetical protein  34.15 
 
 
361 aa  176  6e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0672806 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1046  hypothetical protein  32.76 
 
 
360 aa  175  9.999999999999999e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.00909472  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0798  Smr protein/MutS2  29.05 
 
 
486 aa  154  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.475596 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1833  hypothetical protein  28.07 
 
 
360 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0092  hypothetical protein  23.55 
 
 
366 aa  91.3  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0422  hypothetical protein  21.25 
 
 
381 aa  90.9  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.660011 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3151  hypothetical protein  24.26 
 
 
365 aa  85.9  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00501753 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2128  hypothetical protein  23.56 
 
 
363 aa  84  0.000000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.777089  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0175  hypothetical protein  23.1 
 
 
358 aa  81.3  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.103811  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1671  hypothetical protein  21.64 
 
 
381 aa  60.1  0.00000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.670148  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>