14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4436 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_4436  hypothetical protein  100 
 
 
330 aa  674    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.251781  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3237  hypothetical protein  29.15 
 
 
379 aa  69.3  0.00000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3209  hypothetical protein  30.54 
 
 
389 aa  65.5  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3428  hypothetical protein  26.84 
 
 
403 aa  65.1  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.18191  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1840  hypothetical protein  25.45 
 
 
433 aa  58.9  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.813985  normal  0.403532 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3808  hypothetical protein  21.67 
 
 
428 aa  58.5  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.668523  normal  0.918883 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3869  hypothetical protein  23.87 
 
 
391 aa  57.8  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.356103  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3863  hypothetical protein  23.2 
 
 
376 aa  55.1  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0984668  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3443  polysaccharide pyruvyl transferase  24.78 
 
 
391 aa  54.3  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.940822  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4719  polysaccharide pyruvyl transferase  24.58 
 
 
390 aa  51.6  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0055407 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2604  hypothetical protein  35.14 
 
 
373 aa  51.6  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.394147  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4718  polysaccharide pyruvyl transferase  25.52 
 
 
392 aa  48.1  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.440204  hitchhiker  0.00516951 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17960  hypothetical protein  23.53 
 
 
509 aa  47  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.255586  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0624  hypothetical protein  21.53 
 
 
423 aa  45.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>