16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_17960 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_17960  hypothetical protein  100 
 
 		 509 aa  1029    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.255586  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1840  hypothetical protein  31.4 
 
 		 433 aa  194  3e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.813985  normal  0.403532 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3237  hypothetical protein  27.54 
 
 		 379 aa  113  6e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3869  hypothetical protein  29.53 
 
 		 391 aa  105  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.356103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2604  hypothetical protein  26.85 
 
 		 373 aa  102  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.394147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3863  hypothetical protein  24.16 
 
 		 376 aa  94.4  5e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0984668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3428  hypothetical protein  25.16 
 
 		 403 aa  94  6e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.18191  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3209  hypothetical protein  25.17 
 
 		 389 aa  87  7e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2340  hypothetical protein  25.07 
 
 		 367 aa  84.3  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3442  polysaccharide pyruvyl transferase  28.57 
 
 		 397 aa  84  0.000000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4719  polysaccharide pyruvyl transferase  27.85 
 
 		 390 aa  83.6  0.000000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0055407 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3443  polysaccharide pyruvyl transferase  26.06 
 
 		 391 aa  79.3  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.940822  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0624  hypothetical protein  24.59 
 
 		 423 aa  75.9  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4718  polysaccharide pyruvyl transferase  25.95 
 
 		 392 aa  72.4  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.440204  hitchhiker  0.00516951 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3808  hypothetical protein  28.62 
 
 		 428 aa  68.9  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.668523  normal  0.918883 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4436  hypothetical protein  23.53 
 
 		 330 aa  47.4  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.251781  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>