16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3443 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_3443  polysaccharide pyruvyl transferase  100 
 
 
391 aa  817    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.940822  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4719  polysaccharide pyruvyl transferase  68.21 
 
 
390 aa  589  1e-167  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0055407 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3442  polysaccharide pyruvyl transferase  42.2 
 
 
397 aa  359  5e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4718  polysaccharide pyruvyl transferase  43.96 
 
 
392 aa  350  2e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.440204  hitchhiker  0.00516951 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0624  hypothetical protein  26.09 
 
 
423 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3237  hypothetical protein  27.76 
 
 
379 aa  111  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3869  hypothetical protein  24.93 
 
 
391 aa  107  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.356103  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3863  hypothetical protein  26.71 
 
 
376 aa  98.6  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0984668  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3209  hypothetical protein  22.95 
 
 
389 aa  90.9  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3808  hypothetical protein  27.67 
 
 
428 aa  89.7  9e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.668523  normal  0.918883 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2604  hypothetical protein  25.34 
 
 
373 aa  89  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.394147  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17960  hypothetical protein  26.06 
 
 
509 aa  79.7  0.00000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.255586  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1840  hypothetical protein  22.15 
 
 
433 aa  74.7  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.813985  normal  0.403532 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3428  hypothetical protein  19.82 
 
 
403 aa  67  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.18191  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4436  hypothetical protein  24.78 
 
 
330 aa  54.3  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.251781  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2340  hypothetical protein  24.79 
 
 
367 aa  49.3  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>