16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3237 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_3237  hypothetical protein  100 
 
 		 379 aa  786    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3209  hypothetical protein  31.41 
 
 		 389 aa  187  4e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3863  hypothetical protein  29.31 
 
 		 376 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0984668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2604  hypothetical protein  33.23 
 
 		 373 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.394147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3869  hypothetical protein  28.87 
 
 		 391 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.356103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3428  hypothetical protein  27.57 
 
 		 403 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.18191  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3808  hypothetical protein  29.22 
 
 		 428 aa  128  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.668523  normal  0.918883 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0624  hypothetical protein  28.53 
 
 		 423 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1840  hypothetical protein  26.33 
 
 		 433 aa  115  2.0000000000000002e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.813985  normal  0.403532 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17960  hypothetical protein  27.54 
 
 		 509 aa  114  4.0000000000000004e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.255586  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2340  hypothetical protein  30.43 
 
 		 367 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3443  polysaccharide pyruvyl transferase  27.76 
 
 		 391 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.940822  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4719  polysaccharide pyruvyl transferase  26.58 
 
 		 390 aa  110  5e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0055407 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4718  polysaccharide pyruvyl transferase  28.57 
 
 		 392 aa  103  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.440204  hitchhiker  0.00516951 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3442  polysaccharide pyruvyl transferase  25.86 
 
 		 397 aa  95.5  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4436  hypothetical protein  29.15 
 
 		 330 aa  69.3  0.00000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.251781  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>