16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3863 on replicon NC_009956
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009956  Dshi_3863  hypothetical protein  100 
 
 		 376 aa  783    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0984668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3869  hypothetical protein  46.21 
 
 		 391 aa  296  5e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.356103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3237  hypothetical protein  29.31 
 
 		 379 aa  174  2.9999999999999996e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3209  hypothetical protein  29.22 
 
 		 389 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2604  hypothetical protein  29.85 
 
 		 373 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.394147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4719  polysaccharide pyruvyl transferase  28.73 
 
 		 390 aa  102  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0055407 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3443  polysaccharide pyruvyl transferase  26.71 
 
 		 391 aa  98.6  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.940822  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3808  hypothetical protein  28.9 
 
 		 428 aa  98.6  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.668523  normal  0.918883 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3428  hypothetical protein  24.93 
 
 		 403 aa  95.5  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.18191  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17960  hypothetical protein  24.16 
 
 		 509 aa  94.7  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.255586  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3442  polysaccharide pyruvyl transferase  28.06 
 
 		 397 aa  88.6  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0624  hypothetical protein  26.29 
 
 		 423 aa  86.3  8e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4718  polysaccharide pyruvyl transferase  27.34 
 
 		 392 aa  81.6  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.440204  hitchhiker  0.00516951 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1840  hypothetical protein  21.41 
 
 		 433 aa  79.3  0.0000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.813985  normal  0.403532 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2340  hypothetical protein  24.15 
 
 		 367 aa  75.1  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4436  hypothetical protein  23.2 
 
 		 330 aa  55.1  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.251781  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>