17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3869 on replicon NC_009956
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009956  Dshi_3869  hypothetical protein  100 
 
 		 391 aa  773    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.356103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3863  hypothetical protein  46.04 
 
 		 376 aa  306  4.0000000000000004e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0984668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3237  hypothetical protein  28.83 
 
 		 379 aa  175  9.999999999999999e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3209  hypothetical protein  28.85 
 
 		 389 aa  139  7e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2604  hypothetical protein  32.36 
 
 		 373 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.394147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4719  polysaccharide pyruvyl transferase  27.51 
 
 		 390 aa  124  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0055407 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3808  hypothetical protein  31.49 
 
 		 428 aa  119  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.668523  normal  0.918883 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17960  hypothetical protein  29.86 
 
 		 509 aa  113  6e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.255586  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3443  polysaccharide pyruvyl transferase  25.07 
 
 		 391 aa  110  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.940822  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3428  hypothetical protein  23.8 
 
 		 403 aa  105  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.18191  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2340  hypothetical protein  23.68 
 
 		 367 aa  98.2  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3442  polysaccharide pyruvyl transferase  29.37 
 
 		 397 aa  90.1  6e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4718  polysaccharide pyruvyl transferase  26.7 
 
 		 392 aa  89.4  9e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.440204  hitchhiker  0.00516951 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1840  hypothetical protein  25 
 
 		 433 aa  81.3  0.00000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.813985  normal  0.403532 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0624  hypothetical protein  22.39 
 
 		 423 aa  72  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4436  hypothetical protein  24.28 
 
 		 330 aa  59.7  0.00000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.251781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3101  beta-ketoacyl synthase  31.3 
 
 		 2266 aa  43.9  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>