16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3209 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3209  hypothetical protein  100 
 
 		 389 aa  805    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2604  hypothetical protein  31.35 
 
 		 373 aa  187  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.394147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3237  hypothetical protein  31.41 
 
 		 379 aa  187  4e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3808  hypothetical protein  30.65 
 
 		 428 aa  161  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.668523  normal  0.918883 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3869  hypothetical protein  28.93 
 
 		 391 aa  138  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.356103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3863  hypothetical protein  29.22 
 
 		 376 aa  132  7.999999999999999e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0984668  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0624  hypothetical protein  26.32 
 
 		 423 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3428  hypothetical protein  25.96 
 
 		 403 aa  114  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.18191  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4719  polysaccharide pyruvyl transferase  25.16 
 
 		 390 aa  99.4  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0055407 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1840  hypothetical protein  28.18 
 
 		 433 aa  93.6  6e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.813985  normal  0.403532 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3443  polysaccharide pyruvyl transferase  22.95 
 
 		 391 aa  90.9  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.940822  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4718  polysaccharide pyruvyl transferase  26.79 
 
 		 392 aa  88.6  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.440204  hitchhiker  0.00516951 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17960  hypothetical protein  25.17 
 
 		 509 aa  87  5e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.255586  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3442  polysaccharide pyruvyl transferase  25.09 
 
 		 397 aa  83.2  0.000000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2340  hypothetical protein  28.57 
 
 		 367 aa  81.3  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4436  hypothetical protein  30.54 
 
 		 330 aa  65.5  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.251781  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>