17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4719 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4719  polysaccharide pyruvyl transferase  100 
 
 		 390 aa  812    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0055407 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3443  polysaccharide pyruvyl transferase  68.21 
 
 		 391 aa  589  1e-167  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.940822  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4718  polysaccharide pyruvyl transferase  46.53 
 
 		 392 aa  370  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.440204  hitchhiker  0.00516951 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3442  polysaccharide pyruvyl transferase  46.55 
 
 		 397 aa  370  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3869  hypothetical protein  27.76 
 
 		 391 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.356103  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0624  hypothetical protein  26.05 
 
 		 423 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3237  hypothetical protein  26.58 
 
 		 379 aa  110  5e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3863  hypothetical protein  28.73 
 
 		 376 aa  102  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0984668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3209  hypothetical protein  25.16 
 
 		 389 aa  99.4  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2604  hypothetical protein  26.59 
 
 		 373 aa  90.1  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.394147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17960  hypothetical protein  27.85 
 
 		 509 aa  83.6  0.000000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.255586  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1840  hypothetical protein  25.59 
 
 		 433 aa  80.9  0.00000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.813985  normal  0.403532 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3808  hypothetical protein  25.98 
 
 		 428 aa  76.3  0.0000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.668523  normal  0.918883 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3428  hypothetical protein  20.72 
 
 		 403 aa  70.1  0.00000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.18191  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2340  hypothetical protein  23.49 
 
 		 367 aa  58.9  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4436  hypothetical protein  24.58 
 
 		 330 aa  51.6  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.251781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2364  ATP synthase, A subunit  22.22 
 
 		 590 aa  44.3  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>