26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0221 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_0221  hypothetical protein  100 
 
 
398 aa  820    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.676637  normal  0.491604 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4378  hypothetical protein  57.62 
 
 
390 aa  448  1e-125  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3418  aminoglycoside phosphotransferase  56.19 
 
 
384 aa  448  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.313846  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2685  aminoglycoside phosphotransferase  56.44 
 
 
384 aa  449  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0424  aminoglycoside phosphotransferase  52.74 
 
 
382 aa  410  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0733  aminoglycoside phosphotransferase  51.71 
 
 
385 aa  405  1e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0395  aminoglycoside phosphotransferase  42.36 
 
 
411 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.522703 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1388  aminoglycoside phosphotransferase  43.32 
 
 
411 aa  308  1.0000000000000001e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.450425  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32960  predicted choline kinase involved in LPS biosynthesis  24.74 
 
 
343 aa  56.6  0.0000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.365402 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0164  aminoglycoside phosphotransferase  41.51 
 
 
357 aa  48.5  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1083  aminoglycoside phosphotransferase  40 
 
 
302 aa  47.8  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000707357  unclonable  0.00000000000458118 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0116  aminoglycoside phosphotransferase  34.55 
 
 
379 aa  47.4  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2337  aminoglycoside phosphotransferase  39.06 
 
 
353 aa  47.4  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2871  aminoglycoside phosphotransferase  27.49 
 
 
358 aa  46.6  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.129273  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1459  aminoglycoside phosphotransferase  36.54 
 
 
354 aa  46.6  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.049097  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12410  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  23.03 
 
 
603 aa  46.2  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2291  aminoglycoside phosphotransferase  35.82 
 
 
348 aa  45.8  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1186  aminoglycoside phosphotransferase  32.73 
 
 
429 aa  46.2  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.161649  normal  0.0723481 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01993  predicted aminoglycoside phosphotransferase  31.43 
 
 
380 aa  45.1  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000191703  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0634  aminoglycoside phosphotransferase  34.62 
 
 
370 aa  44.7  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0471  aminoglycoside phosphotransferase  30.91 
 
 
403 aa  44.7  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4576  aminoglycoside phosphotransferase  32.26 
 
 
357 aa  44.7  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.822662 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2457  aminoglycoside phosphotransferase  20.83 
 
 
355 aa  44.3  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00764802 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3299  methylthioribose kinase  25.94 
 
 
400 aa  43.9  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.835593  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3446  methylthioribose kinase  29.41 
 
 
400 aa  43.5  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0124  aminoglycoside phosphotransferase  23.63 
 
 
338 aa  42.7  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187366  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>