24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1770 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1770  hypothetical protein  100 
 
 		 251 aa  511  1e-144  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0562  hypothetical protein  23.36 
 
 		 243 aa  70.9  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002853  hypothetical protein  26.45 
 
 		 243 aa  69.7  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3097  hypothetical protein  23.77 
 
 		 234 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2434  hypothetical protein  23.65 
 
 		 234 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0112124 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1655  hypothetical protein  22.83 
 
 		 235 aa  67  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.215892  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03123  hypothetical protein  26.45 
 
 		 244 aa  67.8  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1399  hypothetical protein  24.88 
 
 		 234 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.205133  hitchhiker  0.0000000422237 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3166  hypothetical protein  22.75 
 
 		 237 aa  65.9  0.0000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00141395  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1589  hypothetical protein  24.39 
 
 		 234 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000668061  unclonable  0.00000000000333402 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2789  hypothetical protein  24.39 
 
 		 234 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00603172  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2769  hypothetical protein  24.39 
 
 		 234 aa  65.5  0.0000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0144163  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2864  hypothetical protein  24.39 
 
 		 234 aa  65.5  0.0000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.420562 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1464  hypothetical protein  23.43 
 
 		 234 aa  65.5  0.0000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.395577  hitchhiker  0.001985 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2685  hypothetical protein  22.59 
 
 		 235 aa  65.1  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0316068  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1452  hypothetical protein  22.59 
 
 		 234 aa  63.9  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.389327  unclonable  0.0000000000496507 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1620  hypothetical protein  22.98 
 
 		 234 aa  63.9  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00313028  hitchhiker  0.00000317582 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02710  hypothetical protein  21.96 
 
 		 234 aa  63.5  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2176  hypothetical protein  24.51 
 
 		 234 aa  61.6  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00337144  normal  0.0701367 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2468  hypothetical protein  25.6 
 
 		 234 aa  60.8  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.205241  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1521  hypothetical protein  23.67 
 
 		 234 aa  60.1  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2607  hypothetical protein  21.95 
 
 		 234 aa  57  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.230142  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3035  hypothetical protein  20 
 
 		 234 aa  47.8  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00530845  normal  0.0353116 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0947  hypothetical protein  22.55 
 
 		 188 aa  43.1  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.690195 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>