24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_1464 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_1464  hypothetical protein  100 
 
 
234 aa  478  1e-134  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.395577  hitchhiker  0.001985 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1452  hypothetical protein  95.3 
 
 
234 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.389327  unclonable  0.0000000000496507 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1399  hypothetical protein  94.87 
 
 
234 aa  455  1e-127  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.205133  hitchhiker  0.0000000422237 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3097  hypothetical protein  88.89 
 
 
234 aa  431  1e-120  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1589  hypothetical protein  82.48 
 
 
234 aa  404  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000668061  unclonable  0.00000000000333402 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2864  hypothetical protein  82.48 
 
 
234 aa  404  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.420562 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2769  hypothetical protein  82.48 
 
 
234 aa  404  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0144163  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2789  hypothetical protein  82.05 
 
 
234 aa  403  1e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00603172  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2468  hypothetical protein  79.06 
 
 
234 aa  391  1e-108  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.205241  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2434  hypothetical protein  64.1 
 
 
234 aa  324  7e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0112124 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2607  hypothetical protein  65.38 
 
 
234 aa  321  5e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.230142  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1620  hypothetical protein  65.81 
 
 
234 aa  319  3e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00313028  hitchhiker  0.00000317582 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2176  hypothetical protein  60.68 
 
 
234 aa  298  4e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00337144  normal  0.0701367 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3035  hypothetical protein  63.68 
 
 
234 aa  297  8e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00530845  normal  0.0353116 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1521  hypothetical protein  58.97 
 
 
234 aa  291  6e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2685  hypothetical protein  58.72 
 
 
235 aa  290  1e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0316068  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1655  hypothetical protein  39.83 
 
 
235 aa  170  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.215892  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3166  hypothetical protein  36.02 
 
 
237 aa  158  6e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00141395  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02710  hypothetical protein  35.47 
 
 
234 aa  145  5e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0562  hypothetical protein  33.75 
 
 
243 aa  129  3e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002853  hypothetical protein  36.09 
 
 
243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03123  hypothetical protein  33.19 
 
 
244 aa  117  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0947  hypothetical protein  34.57 
 
 
188 aa  112  3e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.690195 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1770  hypothetical protein  23.43 
 
 
251 aa  65.5  0.0000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>